次氯酸水与传统的含氯消毒剂在次氯酸含量、杀菌效果、安全性、腐蚀性等方面均存在差异，因此不要把次氯酸水与传统的含氯消毒剂混为一谈！
含氯消毒剂：是指溶于水产生具有杀微生物活性的次氯酸的消毒剂，其杀微生物有效成分常以有效氯表示。含氯消毒剂可杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、病毒、真菌、结核杆菌和细菌芽胞。这类消毒剂包括液氯、84消毒液、次氯酸钠、次氯酸钙、氯化磷酸三钠、二氯异氰尿酸钠、三氯异氰尿酸钠、氯铵T等等。含氯消毒剂的浓度越高，其刺激性、腐蚀性越大、其产生的致癌物越多、对人体及对环境的危害也越大。且非食品等级，多采用工业级原料，成分复杂，冲洗后可能有三分之一残留于物品表面。
微酸性次氯酸水：是一种小分子水，其有效成分是次氯酸（HClO）。次氯酸是人体内一种嗜中性粒细胞吞噬、杀灭病原菌所释放的免疫物质，现在可以通过电解技术生成低浓度的微酸性次氯酸水。对人体而言，它是比次氯酸钠(或氯漂白剂)更安全、更有效的产品。
微酸性次氯酸水具有杀菌效果好、杀菌迅速的特点，能有效杀灭常见的细菌、病毒、真菌和芽孢，同时，微酸性次氯酸水pH值接近中性，通过多项权威认证对人体皮肤和黏膜温和无刺激，使用时亦不需配制，即需即用，使用后还原成水，对环境没有破坏。微酸性次氯酸水目前在日本、美国属于已被列入食品添加剂的除菌产品，是一款不怕误食、可以“入口”的除菌产品，可完全替代传统化学制剂类消毒产品用于日常消毒除菌。