MES系统实施前做好数据准备是企业实施MES系统的必备功课，MES系统需要的主要数据如下：
一、产品BOM数据
BOM主要分EBOM(设计)和MBOM(制造)。EBOM体现产品组成结构，可用来生成物料需求计划。MBOM体现产品的制造过程，可用来生成作业计划，指导实际生产作业。EBOM来源于PDM的EBOM树，导入方式可分为紧密集成和非紧密集成两种。
前者PDM直接和MES对接，利用集成接口导入所需数据，使用简便，但开发量大，两个系统间互相影响，如果以后系统升级可能会影响集成。
后者由PDM中导出生成中间文件，再导入MES生成BOM树，两个系统间无任何直接的数据交换，开发相对容易；即使以后系统升级，只要导入导出的数据格式不变，对系统运行就不会有影响，因此也为很多企业所采用。PDM中可以建立单独的MBOM树(有些甚至还有计划BOM、采购BOM、工艺BOM等)，和EBOM使用同一套图纸和工艺文件，只是节点的组成结构不同，这样就保证了EBOM和MBOM数据源的性。
在其他系统中建立MBOM要涉及到数据的同步维护问题，耗费人力且容易出错。很多企业没有专门的MBOM而只有EBOM，在MES中可考虑采取一种比较简便的方式：根据EBOM，系统自动读取工艺文件建立MBOM，多数情况下也能基本满足使用需求，是低成本的实现方式。BOM由PDM导入MES时，一些节点属性(如自制、外购、外协)也需要同时导入。
二、财务数据
财务数据可导入MES核算生产成本。从很多企业实施信息化项目的经验看，数据对项目成功与否影响很大，因为数据问题以致项目运行不起来甚至失败的例子并不鲜见，因此在项目建设之初就对数据进行规划和准备十分必要。
三、工艺文件数据
MES中工序间的周转系统自动完成，转序依据就是工艺流程，这是MES运行的基础。流程型企业工艺流程比较固定，在MES中直接创建。离散制造型企业，工艺流程很多，系统内创建工作量太大且是重复劳动(工艺文件已有)，可以通过工艺文件写入。
工艺文件中除工艺流程外，还应有设备、工时等信息。设备信息可用于派工时指定设备，工时可用于衡量工作量，也是计算生产排程的依据，系统自动排程对工时的准确性和完整性要求很高，否则排程结果不准确。工艺流程中的工序名称一般要求标准化，这样系统可以按照工序自动派工、核算评估工序产能及对工序进行属性定义。
工序名称不统一会给系统运行带来困难，如果全部重新修改工艺文件工作量太大，可以采取一种更为便捷的办法：在系统内建立新旧工序名称的对照表，由系统自动解析。
四、生产计划和库存数据
生产计划是在ERP中产生，通过接口写入到MES执行，完成后返回ERP。如没有ERP，可在MES中直接生成生产计划。MES和库存管理系统集成，计划产生时自动读取库存数据扣除可用数量，同时指导现场作业配料。
五、物料齐套清单
物料齐套是装配型企业生产管理的难点，在MES中需要重点考虑。物料清单是齐套的依据。物料清单可由MBOM生成、或工艺文件中写入，也可以物料清单文件形式写入。
六、图纸等技术文件数据
出于降低成本以及技术、工艺的需要，很多企业希望能够实现无纸化生产，生产过程中不再使用纸质图纸、工艺等文件，所有文件均在MES中读取，此时需要把文件导入MES。
七、DNC系统数据
DNC系统中的设备、数控程序及任务完成情况等数据写入MES，同时MES把生产任务信息回写入DNC。
八、订货数据
订货数据来自销售部门，可以由CRM系统写入MES，也可手工输入。