由于水基油墨的特性，很多厂家利用超声波清洗时采取一种预浸泡的办法，使网穴内干结的墨渣软化，然后再进行超声波处理。预浸泡液是特配的，PH很高，有助于墨渣软化，超声波处理时的声波水平就可降低并达到清洗效果，而又不致于损坏网穴。而且可以缩短80%～90%的超声波发射时间
清洗时，网纹辊缓慢转动，液池中的高频超声波换能器开始振动，由于这种振动以及辊身的不断回转使液体中的微小气泡不断地接近辊身，持续不断地产生爆裂与振动，在超声波的作用下，不断地冲击辊身以及隐藏在网穴深处的墨渣，使网穴内的墨渣不断地动摇、脱落，从而达到清洁的目的
注意事项
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一、超声波清洗机的频率应该在生产厂商所建议的范围内，用经多次试用所得的频率进行清洗。超声波频率越高，液体内气泡的体积越小，强度也越弱，一般推荐使用的频率为40KHz，在此频率下，会产生最小的气泡深入网穴进行清洗.不过，由于网纹辊的性质及超声波清洗机设计不同，此频率推荐值仅供参考。
二、清洗剂的温度也会影响到清洗质量，温度高，清洗剂黏度就低，液体中的气泡量就会增加，从而增加超声波清洗的能力。清洗剂的温度一般应控制在40～60℃，且清洗剂必须是特殊的超声波清洗剂。
三、超声波清洗机的时间控制非常重要，因为超声波发射的时间越长，就越有可能损伤网纹辊表面以及网穴壁。目前欧美许多国家的超声波清洗机都有预处理系统，一般来讲，保证不损伤网纹辊的安全清洗时间不超过5分钟，实际操作时需要根据不同网纹辊进行调整。
四、超声波清洗的本质不是靠振动来达到清洗的目的，振动仅仅是换能器在工作时所产生的必然副产品；对质量密度越高的被清洗物会产生共震的效果，所以只要是没有暇疵的物品，一般的微震不会产生后果。但陶瓷网纹辊属于密度高而脆的物品，如有损伤裂缝的地方，共震会容易使其更加扩大(金属辊没有此情况)，故在清洗前要仔细检查。但是已有裂缝的陶瓷网纹辊本身属于已经损坏的网辊，在使用中即使不用超声波清洗机改用其他的方法清洗，也极其容易使其损坏程度加重，就如有裂缝的碗等瓷器一样极易损坏。
优势
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超声波在微孔清洗方面的专长
网纹辊虽说有金属辊和陶瓷辊之别，但靠细微的网穴用于储存油墨，以普通的600L/ICH的网纹辊为例，其网穴的孔径约在30微米左右，一般的清洗工具很难有这么细小进入网穴清洗；而超声波所产生的水泡的直径在2-5微米左右,在单个网穴中同时可以进入6-15个水泡物理撞击网穴底部的污垢，从而达到了彻底清洗干净的目的，这不是其他的清洗方法可以比的。目前在世界上基本上微小孔的清洗都使用超声波清洗机，应用的范围非常广泛。
超声波清洗效果更彻底
超声波清洗的原理是超声波换能器在工作时，产生的数亿个肉眼无法看清的水泡，密集而均匀地环绕着网纹辊，不管是平面还是凹陷点，只要水泡能进入接触，就能够把污垢带离。清洗液的作用是活化吸附在网穴内的污垢，使之吸附力能力降低，轻而易举地被超声波所产生的水泡带离，从而达到了清洗彻底的目的。同时超声波产生的水泡是通过撞击带离污垢，属于物理作用，而清洗液则是降低污垢的附着力作用，属于化学作用，好比西医是治标，中医是治本的道理一样，物理和化学原理的结合，使得清洗的更彻底和合理；这是也其他的清洗方法所没有的优点。
不易损伤网纹辊
超声波产生的微小水泡进入网穴，撞击被清洗物的纯物理力量是有限的;撞击的能量是受超声波发生器的功率和频率控制，针对所清洗的对象不同，选择的技术数据也不同。通过控制使得清洗过程中对网纹辊的损伤降低到最小程度。
操作更方便，更环保
超声波清洗是将电能换成动能的绿色环保方法，无粉尘飞扬和污水流淌的现象，耗材是清洗液，用以帮助污垢增加活性，在水泡的作用下容易脱离；整个清洗方法非常简单，在注入清洗液的槽内放入网纹辊后，按下清洗开关即可；选择符合环保的清洗液，可以直接排放下水道。
和其他清洗方式的比较
网纹辊的清洗尽管还有许多其他清洗方法：使用烧碱或强碱加热清洗，高压气喷砂或小苏打干粉直接喷射清洗等，但目前来讲还是使用超声波清洗机相对比较安全和效果好。三种清洗方法对比如下：1）烧碱或加热清洗，属于纯化学作用，优点是价格低廉，但对金属网纹辊容易腐蚀不适宜;虽说陶瓷对强碱有一定的防腐能力，但在加热过程中网纹辊的金属基棍受热膨胀，容易使外层的陶瓷产生龟裂，长期使用强碱也会对陶瓷损伤。2）高压气喷砂或小苏打干粉直接喷射清洗，属于纯物理撞击网纹辊表面,存在着砂或者粉的颗粒粗细不均匀而不能进入网穴深处，对高线数的网纹辊不易清洗彻底；而且直接的高压喷射，长时间使用容易将网纹辊的网墙塌陷。3）使用超声波清洗机，是化学和物理的结合作用，细微的水泡能直接进入网穴，可以清洗高线数的网纹辊;清洗液为中性或偏弱碱，超声波产生的水泡撞击力非常小，相对损伤网纹辊的可能就显得很少。